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TUhjnbcbe - 2025/5/9 17:59:00
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随着非洲猪瘟及新冠疫情的出现,分子诊断(荧光PCR)技术在农业畜牧行业、公共健康领域得到了快速的普及。尤其是在农业畜牧领域,部分实验室仓促上马,基础硬件不是十分完善,在实际运行中,经常会碰到PCR检测结果假阳性的问题。之所以出现假阳性,其本质是样本被阳性核酸(质粒或者靶标核酸气溶胶)污染所致。

下面就PCR实验室出现假阳性(核酸污染)的具体原因及应对措施分析如下:

一、试验室经常出现核酸气溶胶污染的原因:

1.不合理的实验室建设

严格的PCR实验室应有标准的正负压系统及四分区,实验室应按照生物安全二级实验室及PCR实验室设计基本要求来建设。可参考的标准为《GB-建设标准生物安全实验室建筑技术规范》及卫健委下发的《医疗机构临床基因扩增检验实验室工作导则》。标准实验室如下图:

标准化PCR实验室(图片源于网络,侵删)

1.1试验分区不能少于2个:标准化实验室含有四个分区:试剂准备区、样本处理区、扩增区、产物分析区,该分区是基于普通PCR和荧光PCR同时开展的试验;对于大多数尤其是非瘟基层检测实验室,目前主流的是荧光PCR技术,避免了开盖及开放式的扩增操作,因此扩增区和产物分析区可以合并为一个分区;基层PCR实验室可以设置3个分区;但是不能低于2个,如果只有1个分区,即配置、分装、检测均在一个房间,依据笔者经验,只要运行超过一周的,必定会造成实验室环境核酸污染,假阳性率高!

1.2正负压系统:农业领域基层PCR实验室很少装有正负压系统,这就要求我们不同试验区域要保持良好的通风(尤其是扩增区域),且通风口不能朝向对侧试验区域。

1.3生物安全柜:购买二级生物安全柜应选择B2型生物安全柜;A1型、A2型、B1型为70%气体通过HEPA过滤器再循环至工作区;B2型为%全排放型,无内部循环气流。因此只有B2型可以用于加样(阳性对照)。因为HEPA过滤器并不能有效过滤气溶胶质粒。生物安全柜配置错误,再加样的时候很难避免核酸气溶胶污染,且污染很难清除。

1.4紫外灯没有配置:紫外灯除了能杀灭病毒外,针对核酸也能起到降解的作用。一方面来源与紫外线直接作用于核酸或者气溶胶质粒,造成核酸氢键断裂,从而裂解核酸;另一方面,紫外线产生的臭氧也具有强氧化作用,可以降解空气中的核酸。常规消毒剂如酒精、碘化物、戊二醛类、季铵盐等虽然能杀菌,但是不能降解核酸。已知的消毒剂中,次氯酸盐类消毒剂可以一定程度的降解核酸。

2,管理制度不完善:

没有做到人流、物流单向流动;不同试验区域的物品、耗材、器械、实验服混用!试验人员配置低于2名;完善的制度能保证实验持久长期的稳定运行,笔者依据临床经验,凡是实验室物品混匀,试验人员没有分工,只要超过运行15天,实验室出现污染的风险概率达到90%!应至少保证不同区域的物品传递应通过传递窗,人员应保证2名,一名专职配液分装,另一名可以处理样品,上机分析!这是保障基层实验室运行的最低要求。

3,那些容易忽视的操作细节:

3.1处理样品时,没有注意清理手套接触的阳性血污或其他样本,造成其他样本污染。从而造成假阳性;

3.2处理样本时,忘记更换tip枪头,造成样本交叉污染;

3.3吸取阳性对照(质粒)没有遵循“慢吸快打”的原则,造成阳性对照污染枪头,或者在生物安全柜循环风的影响下,造成气溶胶飞溅,污染加样区域。最好使用带有滤芯的枪头。

带滤芯枪头

3.4加样区没有放置桌面垃圾桶:加完样品的tip枪可能含有高浓度的阳性核酸靶标,如果乱丢弃,可能造成气溶胶污染;应把tip枪头丢入含有次氯酸溶液的桌面垃圾桶中。

3.5上机扩增后八连管开盖:扩增产物开盖是一定要禁忌的!虽然现在荧光PCR都含有UNG酶技术来预防扩增产物的污染,但是扩增产物开盖,仍是污染的重要来源。扩增后的八连管,应及时放到含有次氯酸盐的废液桶里浸泡。次氯酸盐其主要作用的是溶于水后产生具有氧化性的次氯酸,有挥发性,因此要定期(2~3)更换浸泡液或者重加加入次氯酸盐。

4,那些容易忽视的污染高风险区域:

在笔者的临床实践中,发现以下区域存在阳性污染:

笔者在某实验室发生污染时,在不同区域采集10个样本,通过PCR扩增分析后,比较不同区域的阳性检出率。发现样品处理区的离心机污染的程度最高(8/10),其次是传递窗(7/10)。不同实验室的污染情况都是不一样的,就像这个世界上,幸福的家庭都一样,不幸的家庭倒是各有各的不幸。同理,规范的实验室都一样,污染的实验室各有各的污染情况。以上数据仅供参考。

二、PCR污染的监测

在日常实验室运行中,要时刻注意监测实验室的污染情况。了解实验室有无污染,污染原因,污染程度,以便采取有效措施,防止和消除污染。一般通过阴阳性对照检测污染情况。

2.1试验过程监测:

目前,多数试剂盒的阴性对照是在配置PCR反应液在扩增这一环节加进去的。不能做到全过程质控。因此,每次开展试验应增加2个纯化水样品,参与核酸提取,扩增,保证实验从样品处理、核酸提取、扩增3个步骤的阴性监控。防止整个试验过程可能存在的阳性污染。

2.2日常实验室环境检测:

监控对象:实验室内的仪器设备、空气、物体表面:

环境监测:每个实验区放置10ml单蒸水水(敞口),1个小时后,取样μl。作为样品,参与提取、扩增,分析实验室环境是否存在气溶胶污染。

物体表面监测:物体表面擦拭取样:用棉拭子蘸取生理盐水,在实验室台面(尤其是四周死角)、仪器表面和内孔涂抹取样后放入约0.5mL生理盐水中取样。作为样品,参与提取、扩增,分析物体表面是否存在气溶胶污染。

三、解决PCR实验室污染的方法

3.1“人、机、料、法、环”:首先针对上述产生气溶胶污染的原因进行分析,从人员、硬件配置、物料、方法(SOP)、环境五个方面进行认真复盘,整改。这是保证实验室长治久安、不发生污染的基本前提。

(图片源于网络,侵删)

3.2选用含有UNG酶防止污染设计的荧光PCR检测试剂盒。该技术可以降低实验室被扩增产物的污染,从而将风险降低至少80%。但是仍有20%的污染风险是由于阳性对照质粒气溶胶产生。UNG酶无法降解阳性质粒。

3.3发生污染时的处理:

(1)更换污染区的耗材(主要是枪头和离心管)、实验服应用次氯酸盐溶液浸泡1小时后,进行洗涤处理;

(2)可以选用没有腐蚀性,对试验人员及环境友好,无刺激的核酸清除剂,例如纳克生物的“PCR核酸质粒气溶胶污染清除剂”(

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